Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chd1P40201 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Chd1P40201 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Chd1P40201 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Chd1P40201 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Chd1P40201 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chd1P40201 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chd1P40201 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Chd1P40201 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chd1P40201 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Chd1P40201 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chd1P40201 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Chd1P40201 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Chd1P40201 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Chd1P40201 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms