Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig1P37913 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig1P37913 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig1P37913 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig1P37913 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig1P37913 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lig1P37913 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lig1P37913 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lig1P37913 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms