Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab20P35295 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab20P35295 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab20P35295 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab20P35295 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab20P35295 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab20P35295 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab20P35295 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms