Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rom1P32958 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rom1P32958 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rom1P32958 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rom1P32958 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rom1P32958 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rom1P32958 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rom1P32958 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rom1P32958 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rom1P32958 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rom1P32958 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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