Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Pabpc1P29341 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms