Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcdP28867 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms