Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprmP28828 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprmP28828 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprmP28828 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprmP28828 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprmP28828 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprmP28828 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprmP28828 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprmP28828 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprmP28828 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprmP28828 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms