Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Marcksl1P28667 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms