Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NapbP28663 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NapbP28663 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NapbP28663 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NapbP28663 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NapbP28663 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NapbP28663 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NapbP28663 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NapbP28663 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NapbP28663 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NapbP28663 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NapbP28663 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NapbP28663 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NapbP28663 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NapbP28663 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NapbP28663 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NapbP28663 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NapbP28663 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NapbP28663 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NapbP28663 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NapbP28663 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NapbP28663 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NapbP28663 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NapbP28663 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NapbP28663 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NapbP28663 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NapbP28663 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NapbP28663 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NapbP28663 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NapbP28663 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NapbP28663 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NapbP28663 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NapbP28663 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NapbP28663 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NapbP28663 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NapbP28663 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NapbP28663 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NapbP28663 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NapbP28663 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NapbP28663 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NapbP28663 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NapbP28663 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NapbP28663 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NapbP28663 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NapbP28663 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NapbP28663 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms