Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk11bP24788 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdk11bP24788 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms