Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znf239P24399 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Znf239P24399 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Znf239P24399 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znf239P24399 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Znf239P24399 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf239P24399 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms