Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZfaP23607 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZfaP23607 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZfaP23607 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZfaP23607 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZfaP23607 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZfaP23607 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms