Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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Pde6bP23440 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde6bP23440 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde6bP23440 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde6bP23440 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde6bP23440 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde6bP23440 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde6bP23440 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde6bP23440 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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Pde6bP23440 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde6bP23440 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde6bP23440 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde6bP23440 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde6bP23440 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde6bP23440 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Pde6bP23440 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pde6bP23440 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pde6bP23440 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Pde6bP23440 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Pde6bP23440 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pde6bP23440 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Pde6bP23440 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms