Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RarbP22605 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RarbP22605 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RarbP22605 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RarbP22605 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RarbP22605 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
RarbP22605 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RarbP22605 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RarbP22605 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RarbP22605 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
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RarbP22605 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RarbP22605 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
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