Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Fcer1aP20489 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcer1aP20489 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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