Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms