Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtpraP18052 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpraP18052 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpraP18052 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpraP18052 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpraP18052 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpraP18052 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpraP18052 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpraP18052 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpraP18052 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpraP18052 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms