Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhoP15409 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhoP15409 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhoP15409 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhoP15409 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhoP15409 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhoP15409 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhoP15409 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhoP15409 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhoP15409 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhoP15409 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RhoP15409 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RhoP15409 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RhoP15409 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RhoP15409 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RhoP15409 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RhoP15409 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RhoP15409 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RhoP15409 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RhoP15409 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RhoP15409 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RhoP15409 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RhoP15409 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RhoP15409 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RhoP15409 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RhoP15409 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RhoP15409 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RhoP15409 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RhoP15409 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RhoP15409 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RhoP15409 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RhoP15409 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RhoP15409 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RhoP15409 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RhoP15409 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RhoP15409 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RhoP15409 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RhoP15409 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RhoP15409 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RhoP15409 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RhoP15409 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RhoP15409 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RhoP15409 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RhoP15409 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RhoP15409 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RhoP15409 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RhoP15409 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RhoP15409 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RhoP15409 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RhoP15409 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RhoP15409 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RhoP15409 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RhoP15409 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RhoP15409 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RhoP15409 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RhoP15409 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RhoP15409 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RhoP15409 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RhoP15409 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RhoP15409 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RhoP15409 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RhoP15409 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RhoP15409 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RhoP15409 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RhoP15409 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RhoP15409 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RhoP15409 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RhoP15409 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RhoP15409 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RhoP15409 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RhoP15409 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RhoP15409 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RhoP15409 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RhoP15409 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RhoP15409 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RhoP15409 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RhoP15409 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RhoP15409 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RhoP15409 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RhoP15409 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RhoP15409 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RhoP15409 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RhoP15409 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RhoP15409 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RhoP15409 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RhoP15409 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RhoP15409 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RhoP15409 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RhoP15409 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RhoP15409 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RhoP15409 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RhoP15409 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RhoP15409 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RhoP15409 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RhoP15409 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RhoP15409 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RhoP15409 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RhoP15409 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RhoP15409 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RhoP15409 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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