Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prf1P10820 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prf1P10820 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prf1P10820 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prf1P10820 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prf1P10820 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prf1P10820 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prf1P10820 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prf1P10820 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prf1P10820 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prf1P10820 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prf1P10820 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prf1P10820 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prf1P10820 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prf1P10820 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prf1P10820 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prf1P10820 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prf1P10820 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prf1P10820 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prf1P10820 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Prf1P10820 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prf1P10820 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prf1P10820 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prf1P10820 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prf1P10820 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prf1P10820 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prf1P10820 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prf1P10820 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prf1P10820 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prf1P10820 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prf1P10820 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prf1P10820 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prf1P10820 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prf1P10820 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prf1P10820 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prf1P10820 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prf1P10820 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prf1P10820 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prf1P10820 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prf1P10820 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prf1P10820 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prf1P10820 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prf1P10820 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prf1P10820 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prf1P10820 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prf1P10820 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prf1P10820 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prf1P10820 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prf1P10820 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prf1P10820 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prf1P10820 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prf1P10820 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prf1P10820 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prf1P10820 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prf1P10820 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prf1P10820 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prf1P10820 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prf1P10820 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prf1P10820 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prf1P10820 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prf1P10820 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prf1P10820 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prf1P10820 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prf1P10820 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prf1P10820 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Prf1P10820 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Prf1P10820 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prf1P10820 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prf1P10820 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prf1P10820 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Prf1P10820 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prf1P10820 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prf1P10820 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prf1P10820 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prf1P10820 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prf1P10820 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prf1P10820 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prf1P10820 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Prf1P10820 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prf1P10820 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prf1P10820 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prf1P10820 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prf1P10820 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Prf1P10820 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prf1P10820 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prf1P10820 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prf1P10820 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prf1P10820 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prf1P10820 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prf1P10820 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prf1P10820 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prf1P10820 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prf1P10820 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prf1P10820 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prf1P10820 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prf1P10820 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Prf1P10820 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prf1P10820 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prf1P10820 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prf1P10820 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms