Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itgb1P09055 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms