Protein–RNA interactions for Protein: P01810

Ig heavy chain V region J539, mousemouse

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Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01810 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01810 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01810 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P01810 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P01810 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01810 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P01810 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P01810 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01810 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01810 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01810 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01810 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01810 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01810 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01810 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01810 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01810 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01810 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01810 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01810 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01810 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01810 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01810 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01810 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01810 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01810 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01810 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01810 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01810 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01810 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01810 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01810 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01810 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01810 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01810 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01810 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01810 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01810 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01810 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01810 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01810 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01810 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01810 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01810 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01810 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01810 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01810 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01810 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01810 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01810 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01810 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01810 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01810 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01810 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01810 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01810 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01810 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01810 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01810 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01810 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01810 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01810 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01810 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01810 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01810 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01810 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01810 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01810 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01810 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01810 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01810 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01810 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01810 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01810 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01810 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01810 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01810 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01810 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01810 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01810 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01810 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01810 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01810 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01810 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01810 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01810 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01810 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01810 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01810 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01810 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01810 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01810 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01810 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01810 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01810 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01810 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01810 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01810 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01810 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01810 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms