Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Gm10509O88255 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Gm10509O88255 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Gm10509O88255 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Gm10509O88255 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Gm10509O88255 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Gm10509O88255 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Gm10509O88255 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Gm10509O88255 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Gm10509O88255 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Gm10509O88255 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Gm10509O88255 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm10509O88255 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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