Protein–RNA interactions for Protein: O70477

Pknox1, Homeobox protein PKNOX1, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox1O70477 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pknox1O70477 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pknox1O70477 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pknox1O70477 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pknox1O70477 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pknox1O70477 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pknox1O70477 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pknox1O70477 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pknox1O70477 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pknox1O70477 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pknox1O70477 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pknox1O70477 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pknox1O70477 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pknox1O70477 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pknox1O70477 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pknox1O70477 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pknox1O70477 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pknox1O70477 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pknox1O70477 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pknox1O70477 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pknox1O70477 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pknox1O70477 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pknox1O70477 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pknox1O70477 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pknox1O70477 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pknox1O70477 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pknox1O70477 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pknox1O70477 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pknox1O70477 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pknox1O70477 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pknox1O70477 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pknox1O70477 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pknox1O70477 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms