Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh16O54909 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh16O54909 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rdh16O54909 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh16O54909 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh16O54909 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh16O54909 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh16O54909 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh16O54909 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh16O54909 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh16O54909 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh16O54909 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh16O54909 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh16O54909 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh16O54909 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh16O54909 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh16O54909 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh16O54909 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh16O54909 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Rdh16O54909 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh16O54909 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh16O54909 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh16O54909 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh16O54909 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh16O54909 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh16O54909 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh16O54909 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh16O54909 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh16O54909 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh16O54909 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh16O54909 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh16O54909 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rdh16O54909 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Rdh16O54909 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Rdh16O54909 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Rdh16O54909 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rdh16O54909 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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