Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffaO54786 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffaO54786 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffaO54786 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffaO54786 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffaO54786 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffaO54786 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffaO54786 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DffaO54786 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffaO54786 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffaO54786 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffaO54786 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffaO54786 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffaO54786 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffaO54786 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffaO54786 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffaO54786 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffaO54786 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffaO54786 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffaO54786 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DffaO54786 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffaO54786 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffaO54786 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffaO54786 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffaO54786 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffaO54786 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffaO54786 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DffaO54786 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffaO54786 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffaO54786 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffaO54786 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffaO54786 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffaO54786 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffaO54786 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffaO54786 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffaO54786 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffaO54786 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DffaO54786 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffaO54786 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffaO54786 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffaO54786 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffaO54786 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffaO54786 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DffaO54786 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffaO54786 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffaO54786 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffaO54786 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffaO54786 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffaO54786 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffaO54786 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffaO54786 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffaO54786 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffaO54786 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DffaO54786 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffaO54786 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffaO54786 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffaO54786 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffaO54786 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffaO54786 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffaO54786 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffaO54786 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffaO54786 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffaO54786 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffaO54786 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffaO54786 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffaO54786 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffaO54786 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DffaO54786 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DffaO54786 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DffaO54786 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DffaO54786 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffaO54786 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffaO54786 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffaO54786 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffaO54786 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffaO54786 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffaO54786 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffaO54786 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffaO54786 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffaO54786 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffaO54786 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffaO54786 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffaO54786 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffaO54786 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DffaO54786 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffaO54786 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DffaO54786 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffaO54786 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DffaO54786 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffaO54786 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffaO54786 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffaO54786 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffaO54786 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DffaO54786 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DffaO54786 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffaO54786 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffaO54786 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffaO54786 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffaO54786 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DffaO54786 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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