Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Phox2bO35690 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phox2bO35690 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phox2bO35690 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phox2bO35690 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phox2bO35690 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phox2bO35690 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phox2bO35690 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms