Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TnxbO35452 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TnxbO35452 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TnxbO35452 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TnxbO35452 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TnxbO35452 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TnxbO35452 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms