Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf5O35445 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf5O35445 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf5O35445 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf5O35445 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf5O35445 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf5O35445 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf5O35445 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf5O35445 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf5O35445 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf5O35445 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf5O35445 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Rnf5O35445 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rnf5O35445 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rnf5O35445 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rnf5O35445 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rnf5O35445 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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