Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Polr1aO35134 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr1aO35134 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms