Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Scarb2O35114 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scarb2O35114 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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