Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ArxO35085 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ArxO35085 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ArxO35085 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ArxO35085 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ArxO35085 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ArxO35085 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ArxO35085 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ArxO35085 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ArxO35085 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ArxO35085 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ArxO35085 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ArxO35085 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ArxO35085 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ArxO35085 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ArxO35085 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ArxO35085 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ArxO35085 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ArxO35085 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ArxO35085 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ArxO35085 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ArxO35085 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ArxO35085 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ArxO35085 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ArxO35085 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ArxO35085 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ArxO35085 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ArxO35085 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ArxO35085 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ArxO35085 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ArxO35085 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ArxO35085 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ArxO35085 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ArxO35085 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ArxO35085 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ArxO35085 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ArxO35085 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ArxO35085 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ArxO35085 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ArxO35085 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ArxO35085 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ArxO35085 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ArxO35085 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ArxO35085 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ArxO35085 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ArxO35085 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ArxO35085 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ArxO35085 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ArxO35085 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ArxO35085 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ArxO35085 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ArxO35085 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ArxO35085 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ArxO35085 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ArxO35085 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ArxO35085 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ArxO35085 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ArxO35085 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ArxO35085 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ArxO35085 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ArxO35085 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ArxO35085 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ArxO35085 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ArxO35085 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ArxO35085 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ArxO35085 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ArxO35085 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ArxO35085 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ArxO35085 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ArxO35085 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ArxO35085 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ArxO35085 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ArxO35085 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ArxO35085 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ArxO35085 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ArxO35085 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ArxO35085 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ArxO35085 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ArxO35085 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ArxO35085 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ArxO35085 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ArxO35085 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ArxO35085 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ArxO35085 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ArxO35085 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ArxO35085 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ArxO35085 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ArxO35085 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ArxO35085 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ArxO35085 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ArxO35085 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ArxO35085 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ArxO35085 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ArxO35085 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ArxO35085 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ArxO35085 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ArxO35085 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ArxO35085 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ArxO35085 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ArxO35085 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms