Protein–RNA interactions for Protein: O09010

Lfng, Beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase lunatic fringe, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LfngO09010 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LfngO09010 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LfngO09010 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LfngO09010 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LfngO09010 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LfngO09010 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LfngO09010 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LfngO09010 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LfngO09010 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LfngO09010 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LfngO09010 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LfngO09010 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LfngO09010 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LfngO09010 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LfngO09010 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LfngO09010 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LfngO09010 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LfngO09010 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LfngO09010 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LfngO09010 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LfngO09010 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LfngO09010 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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LfngO09010 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LfngO09010 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LfngO09010 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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LfngO09010 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LfngO09010 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LfngO09010 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LfngO09010 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LfngO09010 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LfngO09010 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LfngO09010 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LfngO09010 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LfngO09010 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LfngO09010 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LfngO09010 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LfngO09010 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LfngO09010 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LfngO09010 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LfngO09010 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LfngO09010 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LfngO09010 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LfngO09010 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LfngO09010 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LfngO09010 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LfngO09010 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LfngO09010 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LfngO09010 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LfngO09010 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LfngO09010 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LfngO09010 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LfngO09010 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LfngO09010 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LfngO09010 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LfngO09010 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms