Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AlyrefO08583 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AlyrefO08583 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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