Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp35M0QWN7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms