Protein–RNA interactions for Protein: L7N1Z3

Vmn1r80, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r80L7N1Z3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vmn1r80L7N1Z3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vmn1r80L7N1Z3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vmn1r80L7N1Z3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vmn1r80L7N1Z3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vmn1r80L7N1Z3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vmn1r80L7N1Z3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vmn1r80L7N1Z3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vmn1r80L7N1Z3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r80L7N1Z3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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