Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm8888J3QPX5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm8888J3QPX5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms