Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5225J3QPL3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5225J3QPL3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5225J3QPL3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5225J3QPL3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5225J3QPL3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5225J3QPL3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5225J3QPL3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5225J3QPL3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5225J3QPL3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5225J3QPL3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5225J3QPL3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5225J3QPL3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5225J3QPL3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5225J3QPL3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5225J3QPL3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5225J3QPL3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5225J3QPL3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5225J3QPL3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5225J3QPL3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5225J3QPL3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5225J3QPL3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5225J3QPL3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5225J3QPL3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5225J3QPL3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5225J3QPL3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5225J3QPL3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5225J3QPL3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5225J3QPL3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5225J3QPL3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5225J3QPL3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm5225J3QPL3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm5225J3QPL3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm5225J3QPL3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm5225J3QPL3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm5225J3QPL3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm5225J3QPL3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5225J3QPL3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms