Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC1

Gm933, Predicted gene 933, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm933J3QPC1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm933J3QPC1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm933J3QPC1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm933J3QPC1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms