Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm21900J3QP38 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm21900J3QP38 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms