Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm20873J3QMQ9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20873J3QMQ9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20873J3QMQ9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20873J3QMQ9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20873J3QMQ9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20873J3QMQ9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20873J3QMQ9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20873J3QMQ9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20873J3QMQ9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20873J3QMQ9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20873J3QMQ9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20873J3QMQ9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20873J3QMQ9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20873J3QMQ9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20873J3QMQ9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20873J3QMQ9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20873J3QMQ9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20873J3QMQ9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20873J3QMQ9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20873J3QMQ9 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20873J3QMQ9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20873J3QMQ9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20873J3QMQ9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20873J3QMQ9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20873J3QMQ9 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20873J3QMQ9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20873J3QMQ9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20873J3QMQ9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20873J3QMQ9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20873J3QMQ9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20873J3QMQ9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20873J3QMQ9 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20873J3QMQ9 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20873J3QMQ9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20873J3QMQ9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20873J3QMQ9 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm20873J3QMQ9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm20873J3QMQ9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms