Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK1

Sgo2b, Shugoshin 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2bJ3QMK1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgo2bJ3QMK1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms