Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arfgef1G3X9K3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms