Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp32F8VPZ3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Usp32F8VPZ3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms