Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Speer4aF8VPX6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Speer4aF8VPX6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Speer4aF8VPX6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Speer4aF8VPX6 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Speer4aF8VPX6 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Speer4aF8VPX6 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Speer4aF8VPX6 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Speer4aF8VPX6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Speer4aF8VPX6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Speer4aF8VPX6 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Speer4aF8VPX6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Speer4aF8VPX6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Speer4aF8VPX6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Speer4aF8VPX6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Speer4aF8VPX6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Speer4aF8VPX6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Speer4aF8VPX6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Speer4aF8VPX6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Speer4aF8VPX6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Speer4aF8VPX6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Speer4aF8VPX6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Speer4aF8VPX6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Speer4aF8VPX6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Speer4aF8VPX6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Speer4aF8VPX6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Speer4aF8VPX6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Speer4aF8VPX6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Speer4aF8VPX6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Speer4aF8VPX6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Speer4aF8VPX6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Speer4aF8VPX6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Speer4aF8VPX6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Speer4aF8VPX6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Speer4aF8VPX6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms