Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Rnf212F6TQD1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Rnf212F6TQD1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Rnf212F6TQD1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Rnf212F6TQD1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Rnf212F6TQD1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf212F6TQD1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Rnf212F6TQD1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf212F6TQD1 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf212F6TQD1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf212F6TQD1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf212F6TQD1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf212F6TQD1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Rnf212F6TQD1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf212F6TQD1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf212F6TQD1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf212F6TQD1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf212F6TQD1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf212F6TQD1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf212F6TQD1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf212F6TQD1 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf212F6TQD1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf212F6TQD1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf212F6TQD1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf212F6TQD1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf212F6TQD1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnf212F6TQD1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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