Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syngap1F6SEU4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngap1F6SEU4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms