Protein–RNA interactions for Protein: F6RFI0

Gm9887, Predicted gene 9887, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9887F6RFI0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm9887F6RFI0 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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