Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rnf169E9Q7F2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rnf169E9Q7F2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rnf169E9Q7F2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rnf169E9Q7F2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rnf169E9Q7F2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rnf169E9Q7F2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rnf169E9Q7F2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rnf169E9Q7F2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rnf169E9Q7F2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rnf169E9Q7F2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rnf169E9Q7F2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rnf169E9Q7F2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf169E9Q7F2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rnf169E9Q7F2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf169E9Q7F2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf169E9Q7F2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf169E9Q7F2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rnf169E9Q7F2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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