Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc85cE9Q6B2 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc85cE9Q6B2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc85cE9Q6B2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc85cE9Q6B2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85cE9Q6B2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85cE9Q6B2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85cE9Q6B2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc85cE9Q6B2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms