Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fndc1E9Q043 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fndc1E9Q043 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms